目前，对甲减的治疗主要是由甲状腺激素替代治疗，有的病人还需进行病因治疗。
(1)甲状腺激素替代治疗：由于甲减病人自身不能产生足够的甲状腺激素，故需服用甲状腺激素药品来替代治疗。替代用的甲状腺激素药品有3种，即T3、T4和干甲状腺片。
T3：由于作用时间持续较短，故不常用于替代治疗。国内尚无成品药物出售。
T4：在国外许多国家常用T4替代甲状腺激素。每天所需的剂量约为100-200微克。国内尚无成品药物出售。
干甲状腺片：国内甲减病人主要用干甲状腺片进行替代治疗。干甲状腺片含有T3和T4两种甲状腺激素，价格便宜。每天用量40一200毫克。每片剂量多为40毫克，也有含60毫克的。
(2)病因治疗：有的甲减病人还从病因上积极治疗，若是因为药物导致的甲减，减量或停用后，甲减可以自行消失；若是下丘脑或垂体有大肿瘤，行肿瘤切除后，甲减有可能得到不同程度的改善；若是亚急性甲状腺炎引起的甲减，亚急性甲状腺炎治愈后，甲减也会消失；若是长期缺碘引起的甲减，需补充碘的摄入。
